قصة أنمي Tantei Gakuen Q تدور حول أكاديمية للمحققين، وهي مدرسة في اليابان مرخصة من طرف الحكومة تعمل على تخريج محققين أكفاء يساعدون في حل القضايا المستعصية على الشرطة. بطل القصة هو الفتى كـيـو ذكي لديه قوة استنتاج عالية، يحب مساعدة الآخرين، حلمه أن يصبح محققًا، وعندما يسمع عن وجود هذه الأكاديمية يجد أنها أفضل طريق للوصول إلى حلمه فيقرر الدخول إليها. يلتقي في حوادث بالصدفة بمجموعة من الشخصيات الرئيسية الأخرى الذين يصبحون أصدقائه وذلك لأنهم يشاركونه نفس الحلم ونفس المبادىء. أولًامينامي ميغومي، الفتاة التي تمتلك قدرة خاصة تدعى بالذاكرة التصويرية، ثم توياما كينتارو، الشاب القوي الذي يجيد عددًا من فنون القتال كما أنه يتميز بنظر ثاقب ثم كازوما ناروساوا، وهو طفل صغير السن، يلقب بعبقري البرمجة ثري جدًّا، وأخيرًا ريـو، فتى غامض لا نعرف عنه أي معلومات حتى الآن. كل هؤلاء الأصدقاء يدخلون إلى أكاديمية المحققين ويواجهون الكثير من القضايا الصعبة ويتعاونون لحلها في سبيل إظهار المجرمين وتحقيق العدالة. فما هي القضايا التي سيواجهونها؟ وكيف سيقومون بحلها؟ ثم ما الذي يخفيه الفتى الغامض ريو؟
